A Laguna de Bacalar possui sete gradientes distintos de azul, cada um em função da profundidade, do substrato e do carbonato de cálcio que se deposita em sua bacia de calcário. O fenômeno deu à via navegável seu nome colonial — Laguna de los Siete Colores — embora o espectro visível de um barco possa somar mais de uma dúzia de tons, dependendo do ângulo do sol e da estação. A lagoa estende-se por quarenta e dois quilômetros de norte a sul, alimentada por cenotes subterrâneos que mantêm a salinidade próxima de zero e a visibilidade rotineiramente acima de trinta metros. Cronistas espanhóis que chegaram no século XVI observaram a cidade-fortaleza empoleirada acima da margem leste, uma posição defensiva que vigiava tanto a lagoa quanto a rota comercial que conectava a costa caribenha aos assentamentos maias do interior. Hoje, a lagoa permanece como um dos corpos de água doce menos desenvolvidos da Península de Yucatán, suas margens protegidas por uma combinação de designação federal e pelo ritmo lento da infraestrutura regional. Os fretamentos de veleiros privados na lagoa de Bacalar operam a partir de alguns pontos de lançamento ao longo dos perímetros oeste e sul, a maioria sendo operações familiares que mantêm pequenas frotas de barcos pontão, catamarãs e veleiros de casco simples. O Cenote Azul e o Cenote Coquitos ficam dentro dos limites da lagoa, seus sumidouros submersos descendo mais de noventa metros abaixo da superfície e oferecendo pontos de entrada para o sistema aquífero da região. Estromatólitos — colônias vivas de cianobactérias que datam de mais de três bilhões de anos — aglomeram-se nos baixios do sul, perto do Canal dos Piratas, uma passagem estreita que já conectou a lagoa à Baía de Chetumal e serviu como esconderijo para bucaneiros caribenhos durante o século XVII. Um passeio de barco privado em Bacalar permite o ajuste da rota e da duração para corresponder às condições do vento e à luz do dia. As partidas matinais geralmente circulam para o norte, passando pelo manguezal da Ilha dos Pássaros, depois retornam para o sul através das zonas de gradiente, onde a profundidade muda de três metros para vinte na extensão do comprimento de um barco. Os fretamentos à tarde favorecem as enseadas abrigadas ao longo da margem oeste, onde fontes submersas criam bolsões de água fria e a floresta da margem chega ao alcance da mão do convés. A ausência de tráfego motorizado em zonas de conservação designadas mantém o ruído do motor baixo e permite períodos de deriva estendidos sobre os campos de estromatólitos, onde os passageiros podem observar as formações incrustadas de minerais através da água límpida sem perturbar as frágeis esteiras microbianas abaixo.