Die Lagune von Bacalar hat keine Flüsse, keine Nebenflüsse und keinen Zugang zum Meer – ihre sieben unterschiedlichen Schattierungen von Türkis und Kobalt werden vollständig von Cenoten gespeist, die durch den Kalksteinboden nach oben dringen. Die Spanier nannten sie im 16. Jahrhundert Laguna de Siete Colores, obwohl die Maya die Siedlung bereits Jahrhunderte zuvor Sian Ka'an Bakhalal, „Ort, an dem der Himmel geboren wird“, nannten. Die Wassersäule schichtet sich nach Temperatur und Mineraldichte, wobei jede Thermokline das Licht in einer anderen Wellenlänge bricht. Das Ergebnis ist ein so scharfer Farbverlauf, dass Segler berichten, innerhalb eines Paddelschlags von blassem Jade zu tiefem Mitternachtsblau zu wechseln. Ponton-Touren wurden Anfang der 2010er Jahre zum typischen Zugangsmodell der Lagune und ersetzten schmalere Motorboote, die Sedimente aufwirbelten und die Stromatolithen-Kolonien entlang des westlichen Ufers fragmentierten. Diese Mikrobialite – geschichtete Strukturen, die über dreitausend Jahre hinweg von Cyanobakterien aufgebaut wurden – bilden lebende Riffe, die zu den ältesten biologischen Formationen in Mesoamerika gehören. Anbieter von Bacalar-Pontonboot-Touren folgen heute markierten Kanälen, die die Stromatolithen-Zonen umgehen, und halten an ausgewiesenen Schwimmstopps, wo der Seeboden auf fünfzehn Meter abfällt und die Sichtweite über zwanzig Meter hinausreicht. Das südliche Becken der Lagune, bekannt als Cenote Negro, fällt auf neunzig Meter ab, seine Wände sind mit untergetauchten Baumwurzeln behangen, die Taucher als umgekehrte Kathedralen beschreiben. Gruppensegelboote und motorisierte Pontons teilen sich dieselben Abfahrtsstege entlang der Avenida Costera, wobei jedes Schiff für acht bis zwanzig Passagiere konfiguriert ist. Die meisten Boots-Touren in der Lagune von Bacalar beinhalten einen Stopp an der Cenote Esmeralda, einer flachen Senke, in der die Wassertemperatur vier Grad über dem Umgebungsmittelwert liegt, sowie an der Cenote Cocalitos, wo Schwimmer über Stromatolithen-Kuppeln schweben, die zwei Meter unter der Oberfläche sichtbar sind. Ein offener Barservice – typischerweise Rum, Bier und Agua Fresca – läuft während der gesamten Tour und wird mit saisonalem Obst serviert, das bei der Einschiffung geschnitten wird. Die Lagune steht seit 2020 unter föderalem Umweltschutz, was die tägliche Anzahl der Schiffe begrenzt und biologisch abbaubare Sonnencreme in allen Schwimmzonen vorschreibt. Die Abfahrtsfenster konzentrieren sich zwischen acht und zehn Uhr morgens, wenn das Wasser flach ist und der Lichteinfall die Farbbänder mit maximalem Kontrast trennt. Gegen Mittag frischt der Wind aus Osten auf und glättet den Verlauf zu einem milchigen Blau.